La Nativité du sanctuaire est un ensemble qui a varié au fil du temps. Les documents les plus anciens datent de 1779, lorsque les petits anges de la Gloire et l’Enfant Jésus sont mentionnés pour la procession de la nuit de Noël. Entre 1883 et 1884, trois bergers et les Rois mages ont été ajoutés, œuvre de l’artiste Palmero Aurelio Carmona. Au XXe siècle, de petits personnages, des animaux et quelques maisons en carton, en liège et en pierre ont été ajoutés. Aujourd’hui, elle est constituée du Mystère, qui comprend les figures de saint Joseph, de la Vierge et de l’enfant Jésus, les trois rois mages, un page, un ange, deux bergères et quatre bergers en bois sculpté.

Si l’on observe la crèche, on constate que l’ange divise la scène en deux : à gauche, un jardin idéal, avec des colonnes et des fleurs, qui rappelle le monde baroque du XVIIIe siècle, époque à laquelle ont été créées les figures du Mystère et les peintures découpées du bœuf et de la mule ; à droite, un espace dédié à la tradition populaire de l’île, avec une montagne de papier froissé contenant quelques modèles de bâtiments sauvés et identifiés par des photographies d’époque. Au centre de la scène, le Mystère, les Rois et les bergers adorent l’Enfant divin, couché dans un berceau d’or et entouré d’offrandes symboliques.